Экспертный совет содействует защите и развитию в России конкуренции в области образования и науки, в том числе предупреждению и пресечению монополизма и недобросовестной конкуренции. Он также занимается экспертизой документов и оценкой информации, подготовкой предложений по оптимизации законодательства и рекомендаций по совершенствованию госконтроля в области образования и науки, взаимодействует с федеральными, региональными и местными органами исполнительной власти по этим вопросам.
В состав Экспертного совета входят ключевые чиновники ФАС, Минобрнауки, Минпросвещения, Рособрнадзора и других российских ведомств, руководители образовательных учреждений и научных организаций. Кроме того, по решению регулятора в него включаются и отдельные эксперты в области образования и науки, представляющие ассоциации и общественные объединения.